Anàlisi de fragments (GeneMapper)

Aquest servei s'ofereix al Mòdul B.

El seqüenciador automàtic permet l'anàlisi de la grandària i quantitat de fragments de DNA amplificats per PCR i marcats amb fluorescència, mitjançant el software GeneMapper.
Aquesta metodologia utilitza primers marcats amb els mateixos fluorocroms que s'empren en la seqüenciació de DNA. Un dels fluorocroms s'utilitza sempre com a estàndard intern. Aquest estàndard té una doble funció. Primera i més important, donar la mida i la quantitat de cada fragment de PCR, eliminant la variació entre capil·lars. Segona, com a control positiu per al anàlisi, ja que encara que la PCR falli permet al software realitzar una assignació acurada dels resultats.
El GeneMapper ofereix un anàlisi senzill i precís de PCRs múltiples, doncs en una mateixa electroforesi es poden separar diferents fragments combinant grandàries i colors.

Les aplicacions d'aquesta tècnica són:

Equip:

Filtres: D, G5, Any4Dye

COM ENVIAR-NOS LES MOSTRES PER SEQÜENCIAR?

Per seqüenciar més de 16 mostres, cal dur-les en placa (96 de pouets) per a poder-les processar i enviar un arxiu Excel amb el nom de les mostres i les seves coordendades en la placa.
Recordeu indicar a la sol·licitud d'assaig el fluoròfor o el marcador intern, segons el servei requerit (veure la taula següent).


Servei (Mòdul B)	Condicions de les mostres per Seqüenciar
Electroforesi	S'envia el producte de PCR marcat: A l'SGiEB realitzem l'electroforesi de les mostres directament perquè l'usuari porta les mostres ja preparades i marcades. Enviar els 11,3 µl de la barreja (formamida, mostra i marcador intern) en placa de 96 ó en tubs de 0,2ml. Cal indicar amb quin/s fluoròfor/s s'han marcat les mostres.
*Preparació del poducte de PCR amplificat amb el dye* + Electroforesi**	Les mostres venen amplificades amb el dye per l'usuari i a l'SGiEB les acabem de processar. Cal indicar quin marcador intern cal utilitzar (Rox400HD, Rox1000, Liz600). Enviar 5 µl de cada mostra (en fred) en tubs de 0,2 ml.