Nou article: "EccDNA atlas in male mice reveals features protecting genes against transcription-induced eccDNA formation"

Abstract:

eccDNA és un motor de molts càncers i un potencial intermedi en altres trastorns relacionats amb l'edat. No obstant això, es coneix poc sobre els mecanismes subjacents a la formació d'eccDNA al teixit sa i com l'envelliment afecta aquests processos. Aquí, presentem un atles d'eccDNA a set teixits de ratolins mascles de quatre edats. EccDNA es correlaciona amb la cromatina oberta caracteritzada per signatures de H3K27ac i H3K4me1. A més, la càrrega mutacional d'eccDNA en els gens es correlaciona amb la transcripció específica del teixit i augmenta logarítmicament en funció del nivell de transcripció. Tot i així, una població de gens densos en introns amb moltes formes d'empalmament roman protegit de la formació d'eccDNA. També trobem que el nombre total de molècules d'eccDNA no augmenta a mesura que els ratolins envelleixen, a diferència d'altres tipus de mutacions. Les nostres dades revelen un vincle entre la formació d'eccDNA i el nivell de transcripció que pot impulsar l'arquitectura gènica en mamífers.

Dades article:

Liang X, Arrey G, Qin Y, Álvarez-González L, Hariprakash JM, Ma J, Holt S, Han P, Luo Y, Li H, Ruiz-Herrera A, Pilegaard H, Regenberg B. EccDNA atlas in male mice reveals features protecting genes against transcription-induced eccDNA formation. Nat Commun. 2025 Feb 22;16(1):1872. PMID: 39984484; PMCID: PMC11845583.

DOI: 10.1038/s41467-025-57042-y