Biologia Computacional
Línies de Recerca
L'objectiu principal del nostre grup de recerca és el desenvolupament de noves estratègies per combatre les infeccions per bacteris multiresistents (MDR), en particular del grup gramnegatiu (GN). La creixent aparició i propagació de patògens MDR constitueix actualment una de les principals amenaces per a la salut pública a tot el món. L'escassetat d'antimicrobians eficaços per al tractament de les infeccions per bacteris gramnegatius multiresistents és especialment crítica a mesura que s'acumulen casos de pan-resistència (és a dir, a tots els fàrmacs). Per tant, el descobriment de nous objectius i modes d'acció (MoA), menys propicis per a l'evolució de la resistència, s'ha convertit en una necessitat imperiosa. Paral·lelament, s'espera que el desenvolupament de vacunes efectives ofereixi una solució per als grups de població d'alt risc. El nostre equip combina una sèrie de tècniques computacionals i experimentals per a la identificació d'antigens vacunals i candidats a diana antimicrobiana amb nous modes d'acció en bacteris gramnegatius. Bona part d'aquesta investigació es fa en col·laboració amb el grup de Genètica Molecular Bacteriana de l'IBB, liderat pel Dr. Isidre Gibert. Pel que fa als antimicrobians, pretenem explotar els factors de virulència conservats com a noves dianes de fàrmacs, reduint la capacitat patògena dels bacteris així com la pressió de selecció de fenotips resistents als fàrmacs i evitant l'efecte devastador del tractament amb antibiòtics sobre la microbiota del pacient. En aquestes àrees el nostre grup ha coordinat dos projectes europeus dins de l'FP6 ( BacAbs , identificació de nous antígens) i FP7 ( AntiPathoGN , identificació de noves dianes i antibacterians).
En concret, ens dediquem als següents tipus d'activitats:
- Desenvolupament de mètodes bioinformàtics per a la identificació de noves dianes de fàrmacs antimicrobians, antígens i els seus epítops en bacteris patògens.
- Validació i caracterització experimental d'antígens i dianes de fàrmacs antimicrobians identificats (en col·laboració).
- Modelització i simulació biomolecular per al disseny de vacunes sintètiques.
- Detecció virtual basada en objectius per al descobriment de fàrmacs antimicrobians.
- Validació experimental de compostos antimicrobians d'èxit (en col·laboració).